<br>Hi Carson,<div>Thank you very much for your suggestion, will try that up and let you know.</div><div><br></div><div>by the way <span style>i did found this in one of the revisions at the svn  </span><a href="http://malachite.genetics.utah.edu/projects/maker/browser/bin/gff3_2_gbk?rev=217" target="_blank" style>http://malachite.genetics.utah.edu/projects/maker/browser/bin/gff3_2_gbk?rev=217</a><span style> , i wonder why it gets pulled out on the later revision..</span></div>
<div><br></div><div><br><div class="gmail_quote">On Mon, Mar 19, 2012 at 6:21 AM, Carson Holt <span dir="ltr"><<a href="mailto:carsonhh@gmail.com">carsonhh@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Try using Apollo.  You can open up GFF3 files and them save them as<br>
GenBank format.  That might be sufficient.<br>
<br>
Alternatively.  I've attached a script that can convert SNAP's ZFF format<br>
to GeneBank.  You could then use the maker2zff that comes with MAKER to<br>
convert results to ZFF and then this script to get GenBank format.<br>
<br>
Thanks,<br>
Carson<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On 12-03-14 1:31 AM, "Joe Wilders" <<a href="mailto:joe.wilders@gmail.com">joe.wilders@gmail.com</a>> wrote:<br>
<br>
>Dear MAKER experts,<br>
><br>
>i hope that you can share your expertise regarding, conversion of<br>
>maker gff3 to genbank tbl or gbk. im trying to produce a working<br>
>genbank tbl, i tried converting to chado using maker2chado and<br>
>gmodtools genbanksubmit writer. but so far it doesnt end well. most<br>
>probably due to xml configuration(which im really loss, especially<br>
>defining the "goldenpath") .is there any other way to produce the tbl<br>
>from maker output?<br>
><br>
>thanks :)<br>
><br>
>Joe Wilders<br>
><br>
>_______________________________________________<br>
>maker-devel mailing list<br>
><a href="mailto:maker-devel@box290.bluehost.com">maker-devel@box290.bluehost.com</a><br>
><a href="http://box290.bluehost.com/mailman/listinfo/maker-devel_yandell-lab.org" target="_blank">http://box290.bluehost.com/mailman/listinfo/maker-devel_yandell-lab.org</a><br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br></div>