Hi,<br><br>I'm running maker 2.24-beta. At least 10-15% of scaffolds are failing with the following error:<br><span style="font-family: courier new,monospace;"></span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">Preparing evidence for hint based annotation</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">cleaning clusters....</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">total clusters:1 now processing 0</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">in cluster::shadow_cluster...</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">...finished clustering.</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">cleaning clusters....</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">total clusters:4 now processing 0</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;"> ...processing 0 of 3</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;"> ...processing 1 of 3</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">total clusters:4 now processing 0</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;"> ...processing 0 of 2</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">total clusters:4 now processing 0</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">total clusters:4 now processing 0</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">Can't call method "start" on an undefined valueERROR: Failed while preparing evidence clusters for annotations</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">ERROR: Chunk failed at level:0, tier_type:3</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">FAILED CONTIG:scaffold93.1</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">ERROR: Chunk failed at level:7, tier_type:0</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><span style="font-family: courier new,monospace;">FAILED CONTIG:scaffold93.1</span><br style="font-family: courier new,monospace;"><br>This occurs when running just a single maker instance. <br><br>Thanks,<br>Evan<br>