Hi everyone,<div><br></div><div>I have been retrying installing maker on our university cluster, everything seems to install correctly, but when I run maker I find the following error message:</div><div><br></div><div><div>
Ran into unknown state (hex char: 29) at /home/weckalba/RNAseq/maker/lib/File/..//Proc/Signal.pm line 94.</div><div>A data structure will be created for you at:</div><div>/scratch/weckalba/Maker/genome.maker.output/genome_datastore</div>
<div><br></div><div>To access files for individual sequences use the datastore index:</div><div>/scratch/weckalba/Maker/genome.maker.output/genome_master_datastore_index.log</div><div><br></div><div>DBD::SQLite::db do failed: disk I/O error at /home/weckalba/RNAseq/maker/bin/../lib/GFFDB.pm line 88.</div>
<div>DBD::SQLite::db selectcol_arrayref failed: disk I/O error at /home/weckalba/RNAseq/maker/bin/../lib/GFFDB.pm line 90.</div><div>DBD::SQLite::db do failed: disk I/O error at /home/weckalba/RNAseq/maker/bin/../lib/GFFDB.pm line 92.</div>
<div>DBD::SQLite::db do failed: disk I/O error at /home/weckalba/RNAseq/maker/bin/../lib/GFFDB.pm line 161.</div></div><div><br></div><div><br></div><div>Seems to have something to do with permissions and DBD::SQLite.  I installed DBD::SQLite on my own home directories and routed the perl path to it (and other CPAN installs in the same directories).</div>
<div><br></div><div>I was wondering if anyone ever encountered this before and knew a work around.  The admins for our cluster are unfortunately very slow to respond.</div><div><br></div><div>Thanks</div><div><br></div><div>
Walter</div>