
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">

</head>

<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">

<div>

<div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, sans-serif; font-size: 14px; ">

Hi, I was trying to run maker 2.26. It was compiled with MPI. The non-mpi executable works just fine. But I got the error below while running mpirun Цn maker ЕЕ</div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, sans-serif; font-size: 14px; ">

<br>

</div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, sans-serif; font-size: 14px; ">

What is this Iterator::Fasta::skip_file? Any idea what is going on here?</div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, sans-serif; font-size: 14px; ">

<br>

</div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, sans-serif; font-size: 14px; ">

Oscar</div>

<div style="font-family: Calibri, sans-serif; font-size: 14px; ">

<div style="color: rgb(0, 0, 0); "><br>

</div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); ">STATUS: Processing and indexing input FASTA files...</div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); ">STATUS: Setting up database for any GFF3 input...</div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); ">A data structure will be created for you at:</div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); ">/work/02045/jiao/modules/Maker-GMOD/maker2.26/data/dpp_contig.maker.output/dpp_contig_datastore</div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); "><br>

</div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); ">To access files for individual sequences use the datastore index:</div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); ">/work/02045/jiao/modules/Maker-GMOD/maker2.26/data/dpp_contig.maker.output/dpp_contig_master_datastore_index.log</div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); "><br>

</div>

<div><font class="Apple-style-span" color="#ff0000">ERROR: Log file does not exist in Iterator::Fasta::skip_file</font></div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); ">MPI process (rank: 8) terminated unexpectedly on c341-213.ls4.tacc.utexas.edu</div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); ">Exit code -5 signaled from c341-213</div>

</div>

<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, sans-serif; font-size: 14px; ">

<br>

</div>

</div>

</div>

</body>

</html>