Hi Dr. Holt,<br><br>I just installed maker-2.26-beta  in a lunix-64 bite server with Ubuntu 12.<br>But when I ran maker, I got an error message show segmentation fault (see below):<br><br>STATUS: Parsing control files...<br>

STATUS: Processing and indexing input FASTA files...<br>
程式記憶體區段錯誤 (core dumped)<br><br>I updated the three modules, AnyDBM_File, BDB::SQLlite, or BerkeleyDB. And then I run the fix in maker/lib<br><br>"sed -i 's/qw(DB_File GDBM_File NDBM_File SDBM_File)/qw(DB_File)/' $(grep -l 'DB_File GDBM_File NDBM_File SDBM_File' *)"<br>
<br>Now maker seems to work!<br>  <br>However, I could not follow the next step based on your response in the google discussion group,<br>"You may also have to run the fix below on wherever Bioperl is installed as
<br>well, because it contains the same (DB_File GDBM_File NDBM_File SDBM_File)
<br>statement in the Bio::DB::Fasta module in one of the BEGIN statements."
<br><br>I tried to run this fix in the folder (/usr/local/share/perl/5.14.2/Bio/LiveSeq/IO/) containing Bioperl.pm. But it showed:<br>sed: 沒有輸入檔案 (it means no input files)<br>I want to ask if this step is necessary? If so, what is the directory where I should run the fix?<br>
<br>Thanks,<br><br>Chih-Ming<br><br><br>Chih-Ming Hung<br>Postdoctoral researcher'<br>Department of Life Science<br>National Taiwan Normal University<br>Taipei, Taiwan<br>Email: <a href="mailto:ymwur1@gmail.com">ymwur1@gmail.com</a><br>
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