Hello,<div><br></div><div>I ran MAKER 2.27 using the option pred_stats=1 in the control file. In the last column of the maker output gff file I have the following annotation quality measures.</div><div><br></div><div>AED:0.41 eAED:0.41 QI:0|0.5|0.4|1|1|1|5|0|278</div>
<div><br></div><div>My understanding is that with AED score 0 your annotations are in prefect agreement with the evidence data sets and with AED 1,vice versa.</div><div><br></div><div> I would like to know what is the difference between AED against eAED score. And how do I interpret the QI cloumn?</div>
<div><br></div><div>Thank you,</div><div><div><br></div>-- <br><font face="'courier new', monospace"><b><div><br></div><div>Kapeel Chougule</div><div>Systems Programmer</div><div>Arizona Genomics Institute (AGI)</div>
<div>Thomas W. Keating Bioresearch Building</div><div>University of Arizona</div><div>1657 E. Helen Street</div><div>Tucson, AZ 85719      </div><div><a href="http://www.genome.arizona.edu" target="_blank">www.genome.arizona.edu</a></div>
</b></font>
</div>