<html dir="ltr">

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style id="owaParaStyle" type="text/css">P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>

</head>

<body ocsi="0" fpstyle="1">

<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">Hi,<br>

<br>

 I want to generate gene models for all my transcripts (based on just the transcript evidence). To do this I set 'est2genome to gene models' attribute to 1. I have disabled gene predictions from any another sources, that is, I do not provide protein data and

 turned off all gene predictors<br>

But I find gene models are not generated for all transcripts only about half of them.

<br>

<br>

Can you tell me how maker decides which transcripts to predict models for, that is, how is it making this selective decision?<br>

<br>

Thanks,<br>

Ranjani<br>

</div>

</body>

</html>