Hi all,<div><br><div>I'l' take a shot at answering this one. </div><div><br></div><div>MAKER-P is largely a project name and represents our efforts to benchmark and improve MAKER's performance on plants. The version 2.27 release of MAKER has bug fixes and performance enhancements incorporated as a result of things we learned while bench marking MAKER on arabidopsis and maize; and the de novo annotation of sacred lotus and the algae Nannochloropsis. These changes did not impair MAKER's performance on animal genomes, so at this point we have opted not to maintain two versions of MAKER.</div>
<div><br></div><div>Other people on the project are welcome to weigh in if they would like.</div><div><br></div><div>Mike<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Jan 24, 2013 at 1:31 PM, Carson Holt <span dir="ltr"><<a href="mailto:carsonhh@gmail.com" target="_blank">carsonhh@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">I'm forwarding this to the most relevant people.<br>
<br>
--Carson<br>
<br>
<br>
On 13-01-24 3:17 PM, "Shane Brubaker" <<a href="mailto:sbrubaker@solazyme.com">sbrubaker@solazyme.com</a>> wrote:<br>
<br>
>Hi, I heard about Maker-P at PAG.  We are working on an algae, which is<br>
>closer to plants than just about anything else - I am wondering, would<br>
>Maker-P be useful for us to use instead of regular Maker?<br>
><br>
>_______________________________________________<br>
>maker-devel mailing list<br>
><a href="mailto:maker-devel@box290.bluehost.com">maker-devel@box290.bluehost.com</a><br>
><a href="http://box290.bluehost.com/mailman/listinfo/maker-devel_yandell-lab.org" target="_blank">http://box290.bluehost.com/mailman/listinfo/maker-devel_yandell-lab.org</a><br>
<br>
<br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Michael Campbell MS, RD.<br>Graduate Student<br>Eccles Institute of Human Genetics<br>
University of Utah<br>
15 North 2030 East, Room 2100<br>
Salt Lake City, UT 84112-5330<br>ph:585-3543<br><br>
</div></div>