<p>Unlikely. Probably safer to export what has finished as gff and run it as re-annotation if you don't want to waste what was alteady processed for running additional iterations. </p>
<p>Dan</p>
<p>from me phone...</p>
<div class="gmail_quote">On Mar 4, 2013 8:52 PM, "Kenlee Nakasugi" <<a href="mailto:kenlee.nakasugi@sydney.edu.au">kenlee.nakasugi@sydney.edu.au</a>> wrote:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">




<div bgcolor="#FFFFFF">
<div>Thanks Carson. Will Maker 2.27 be able to continue analysis on Maker 2.1 files that stopped halfway? </div>
<div>Thanks</div>
<div>Ken<br>
<br>
<br>
</div>
<div><br>
On 05/03/2013, at 1:44 AM, "Carson Holt" <<a href="mailto:carsonhh@gmail.com" target="_blank">carsonhh@gmail.com</a>> wrote:<br>
<br>
</div>
<div></div>
<blockquote type="cite">
<div>
<div>Use the last MPICH2 version, as MPICH3 is very different (it's the first attempt to implement the new MPI3 protocol set, and not just a version update).  Alternatively you can use OpenMPI.  Also use maker version 2.27 instead for MPI.</div>

<div><br>
</div>
<div>Thanks,</div>
<div>Carson</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<span>
<div style="border-right:medium none;padding-right:0in;padding-left:0in;padding-top:3pt;text-align:left;font-size:11pt;border-bottom:medium none;font-family:Calibri;border-top:#b5c4df 1pt solid;padding-bottom:0in;border-left:medium none">

<span style="font-weight:bold">From: </span>Kenlee Nakasugi <<a href="mailto:kenlee.nakasugi@sydney.edu.au" target="_blank">kenlee.nakasugi@sydney.edu.au</a>><br>
<span style="font-weight:bold">Date: </span>Sunday, 3 March, 2013 6:44 PM<br>
<span style="font-weight:bold">To: </span>"<a href="mailto:maker-devel@yandell-lab.org" target="_blank">maker-devel@yandell-lab.org</a> List" <<a href="mailto:maker-devel@yandell-lab.org" target="_blank">maker-devel@yandell-lab.org</a>><br>

<span style="font-weight:bold">Subject: </span>[maker-devel] regarding mpich<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>

<div>Hi, <br>
<br>
I'm trying to install mpi_maker (Maker 2.1) on a new system (intel ix x86_64) which has mpich v3.0.2 installed, but I can't seem to get maker Build.PL to recognize it. I tried editing the Build.pm file to point to it, but with no success.
<br>
All dependencies have been installed and successfully recognized, it is just MPI support that is not.
<br>
<br>
Is there anything I could modify in the install scripts to make it recognize this? Currently, the directly path to where the mpicc and mpiexec are is /apps/mpich/3.0.2/bin<br>
I don't have sys admin rights for the machine, and I'm not sure if this version of mpich was installed for shared libraries as per the GMOD tutorial. But I have previously circumvented this with an earlier version of mpich by modifying the Build.pm module with
 success. I'm wondering if mpichv3.02 is not compatible? <br>
<br>
<br>
Cheers, <br>
Ken<br>
<br>
<table cellspacing="0" cellpadding="0" width="100%">
<tbody>
<tr>
<td>
<pre>-- 
Kenlee Nakasugi | Research Fellow
School of Molecular Bioscience
Level 8, SMB Building (G08)| The University of Sydney | NSW | 2006
T: <a href="tel:%2B61%202%209114%201321" value="+61291141321" target="_blank">+61 2 9114 1321</a>
E: <a href="mailto:kenlee.nakasugi@sydney.edu.au" target="_blank">kenlee.nakasugi@sydney.edu.au</a></pre>
</td>
</tr>
</tbody>
</table>
</div>
</div>
_______________________________________________ maker-devel mailing list <a href="mailto:maker-devel@box290.bluehost.com" target="_blank">
maker-devel@box290.bluehost.com</a> <a href="http://box290.bluehost.com/mailman/listinfo/maker-devel_yandell-lab.org" target="_blank">
http://box290.bluehost.com/mailman/listinfo/maker-devel_yandell-lab.org</a> </span>
</div>
</blockquote>
</div>

<br>_______________________________________________<br>
maker-devel mailing list<br>
<a href="mailto:maker-devel@box290.bluehost.com">maker-devel@box290.bluehost.com</a><br>
<a href="http://box290.bluehost.com/mailman/listinfo/maker-devel_yandell-lab.org" target="_blank">http://box290.bluehost.com/mailman/listinfo/maker-devel_yandell-lab.org</a><br>
<br></blockquote></div>