<div dir="ltr">Hi Maker developers, <div><br></div><div style>I met a problem when I was using Maker version 2.27 beta version that the pipeline terminated in the middle of the process without any error message. </div><div style>
<br></div><div style><br></div><div style>The genome I am working with is a Eukaryotic genome which is consisted by around 6000 scaffolds. I combined de novo (Augustus and SNAP) and evidence based (protein from a closely related species and transcriptome from the same species) for the gene prediction (the genome is already repeat masked). The MPI (mpich2 version 1.5) enabled maker was run on a cluster by using SGE. I checked with the administrator of our cluster, there is no limitation of SGE job. </div>
<div style><br></div><div style>The maker was run by using  mpiexec -n 48  /home/shafan/maker/bin/maker  maker_opts.ctl maker_bopts.ctl maker_exe.ctl</div><div style><br></div><div style>I attached my maker_opt.ctl, please let me know if you need any information for this problem. </div>
<div style><br></div><div style>Thanks a lot!</div><div style><br></div><div style>Shaohua </div></div>