<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; color: rgb(0, 0, 0); font-size: 14px; font-family: Calibri, sans-serif; "><div>I haven't seen that before, so could you package up the job (all input and control files) that generates this and send it to me.  Your using maker's prokaryotic settings to try and get it to annotate viral genomes, correct?</div><div><br></div><div>--Carson</div><div><br></div><span id="OLK_SRC_BODY_SECTION"><div style="font-family:Calibri; font-size:11pt; text-align:left; color:black; BORDER-BOTTOM: medium none; BORDER-LEFT: medium none; PADDING-BOTTOM: 0in; PADDING-LEFT: 0in; PADDING-RIGHT: 0in; BORDER-TOP: #b5c4df 1pt solid; BORDER-RIGHT: medium none; PADDING-TOP: 3pt"><span style="font-weight:bold">From: </span> Hung-Wei Hsu <<a href="mailto:ares711122@gmail.com">ares711122@gmail.com</a>><br><span style="font-weight:bold">Date: </span> Monday, 25 March, 2013 10:50 PM<br><span style="font-weight:bold">To: </span> <<a href="mailto:maker-devel@yandell-lab.org">maker-devel@yandell-lab.org</a>><br><span style="font-weight:bold">Subject: </span> [maker-devel] Why are some start positions minus in the gff result?<br></div><div><br></div><div dir="ltr"><span style="font-size: 14px; font-family: arial, sans-serif; ">Hi MAKER developers,</span><br><div><span style="font-size: 14px; font-family: arial, sans-serif; "><br></span></div><div style=""><span style="font-size: 14px; font-family: arial, sans-serif; ">I could successfully run MAKER and get the final gff.</span></div><div style=""><span style="font-size: 14px; font-family: arial, sans-serif; ">But I found some start positions in the gff were minus.</span></div><div style=""><span style="font-size: 14px; font-family: arial, sans-serif; ">That led to error in the gff reader.</span></div><div style=""><font face="arial,sans-serif"><span style="font-size:14px">Is this a bug?</span></font></div><div style=""><font face="arial,sans-serif"><span style="font-size:14px">Could you please help to resolve this problem?</span></font></div><div style=""><font face="arial,sans-serif"><span style="font-size:14px">Thanks a lot in advance.</span></font></div><div style=""><font face="arial,sans-serif"><span style="font-size:14px"><br></span></font></div><div style=""><font face="arial,sans-serif"><span style="font-size:14px">Best regards,</span></font></div><div style=""><font face="arial,sans-serif"><span style="font-size:14px">Hung-Wei</span></font></div></div>
_______________________________________________
maker-devel mailing list
<a href="mailto:maker-devel@box290.bluehost.com">maker-devel@box290.bluehost.com</a>
<a href="http://box290.bluehost.com/mailman/listinfo/maker-devel_yandell-lab.org">http://box290.bluehost.com/mailman/listinfo/maker-devel_yandell-lab.org</a>
</span></body></html>