<div dir="ltr">Hi Carson,<div><br></div><div style>When I tried to merge all gff files, I got this error:</div><div style><br></div><div style>ERROR: The file './FINISHED/FINISHED.gff' does not exist</div><div style>
<br></div><div style>and I found something like below in master_datastore_index.log. Is this caused by the duplicate scaffold?</div><div style><div><br></div><div><div>C12919781       GapCloser-Nigro-Min1k_datastore/28/79/C12919781/        FINISHED</div>
<div>        FINISHED</div><div>scaffold138015  GapCloser-Nigro-Min1k_datastore/F7/0C/scaffold138015/   FINISHED</div></div><div><br></div><div><br></div><div style>FASTA lines for C12919781  and scaffold138015</div><div style>
<br></div><div style><div>>C12919781 36.0</div><div>>C12919781 36.0</div><div>CGTAAATGCATCCGCGTATAAATGCGACAGTAAGAGTTAATGATGCAGTATAAAAAGCAAGAAAAAGCGTTTATGGTGGGAGGCGGAGGCATCCAACTAACACCAGACTGTTAACCCGGAGACCAGTGGTCGACACCGTCG(skip...)</div>
<div>>scaffold138015 35.1</div><div>ATATGCATATGCATATGCATATGCATATGCATATGCATATATAGACATGTAGATATAGACATCAATCATACACGTAACCCATCATTCGTATTATTAAATCACATTTTGTGACTTTGCCCATCTGTCTTTAAAGGGACAATGTGTATG(skip...)</div><div><br></div></div>
<div style>maker 2.27</div><div style><br></div><div style>Thanks,</div><div style>Yunfei</div></div></div>