<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>I noticed that this empty output may be because I am only using SwissProt protein sequences as evidence, because I do not have any EST or transcript data generated for my organism.</div>


<div><br></div><div>My question is, how does one proceed to train and generate final annotation starting with only the assembled genome sequence and UniProt/SwissProt sequences?</div><div><br></div><div>Please advise.</div>


<div><br></div><div>Thanks very much.</div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Dec 2, 2013 at 11:53 AM, mun hua <span dir="ltr"><<a href="mailto:mh.tan85@gmail.com" target="_blank">mh.tan85@gmail.com</a>></span> wrote:<br>


<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi<div><br></div><div>I'm trying to create training data for SNAP using the maker2zff script that comes with the maker package version 2.28.</div>


<div>I'm having the same problem as mentioned in this post: <a href="https://groups.google.com/forum/#!searchin/maker-devel/maker2zff/maker-devel/_Pq65Fb761U/s826h5lSxnYJ" target="_blank">https://groups.google.com/forum/#!searchin/maker-devel/maker2zff/maker-devel/_Pq65Fb761U/s826h5lSxnYJ</a></div>



<div>My genome.ann and genome.dna files are empty, but no errors were printed.</div><div><br></div><div>Any advice on this?</div><div><br></div><div>Thanks.</div><span><font color="#888888"><div>Mun Hua</div>
</font></span></div>
</blockquote></div><br></div></div>