<div dir="ltr">I sent the following message to Carson but forgot to send to the maker-devel list<br><div><div class="gmail_quote"><br><div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div><div>Hi Carson,<br><br></div><div>Again need your help!<br>
<br></div>With your guidance, I have the gene models for my genomes. Now I am trying to assign functions to the gene models. I noticed that I can use maker_functional_gff/fasta or interproScan. I dig out some old messages in maker-devel google group, but still have a few questions:<br>

<br></div>1. Will maker_functional_gff/fasta take NCBI blastp results, or only wu-blast results? I do not have wu-blast.<br><br></div>2. Do I have to use Uniprot/Swiss_prot database or I can use something else? For example, may I add a few high-quality genome annotations of related species to the swiss_prot database? Or may I use Uniref90 or nr database instead of swiss_prot?<br>

<br></div>3. Do you have a script to integrate blast2go results to the maker gff/fasta?  <br><br></div>Thanks.<br><br></div>Guohong<br><br></div>Rutgers University <br></div>
</div><br></div></div>