<div dir="ltr">I've used this script I wrote to make the necessary input files from maker GFF3.<div><br><div><a href="https://github.com/hyphaltip/genome-scripts/blob/master/gene_prediction/maker2evm.pl">https://github.com/hyphaltip/genome-scripts/blob/master/gene_prediction/maker2evm.pl</a><br>

</div></div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div dir="ltr">Jason Stajich<br><a href="mailto:jason@bioperl.org" target="_blank">jason@bioperl.org</a><br><a href="http://bioperl.org/wiki/User:Jason" target="_blank">http://bioperl.org/wiki/User:Jason</a><br>

<a href="http://twitter.com/hyphaltip" target="_blank">http://twitter.com/hyphaltip</a></div></div>
<br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Mar 25, 2014 at 9:33 AM, dhivya arasappan <span dir="ltr"><<a href="mailto:darasappan@gmail.com" target="_blank">darasappan@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

Hi Carson and others,<br>
<br>
Is there an easy tool/pipeline available as part of maker utilities to convert maker and SNAP output to files acceptable by EvidenceModeler?<br>
<br>
It looks like it also needs just gff files, but with a few tweaks. EvidenceModeler seems better equipped to handle PASA annotation results than maker results.<br>
<br>
Thanks<br>
Dhivya<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
maker-devel mailing list<br>
<a href="mailto:maker-devel@box290.bluehost.com">maker-devel@box290.bluehost.com</a><br>
<a href="http://box290.bluehost.com/mailman/listinfo/maker-devel_yandell-lab.org" target="_blank">http://box290.bluehost.com/mailman/listinfo/maker-devel_yandell-lab.org</a><br>
</blockquote></div><br></div>