<div dir="ltr"><div><div>Hello again!<br><br></div>About a year ago I asked about using precomputed alignments with Maker. The thread quickly took a different direction as we tried to track down other issues, and I never got the thread back on its original track.<br>

<br></div>So, to return to the original question, what exactly is required when providing pre-computed alignments in GFF3 format? For example, does it affect Maker's behavior whether a score is given? The "Target" attribute? The "Gap" attribute?<br>

<br>Thanks!<br clear="all"><div><div><div><div><div dir="ltr"><br>--<br>Daniel S. Standage<br>Ph.D. Candidate<br>Computational Genome Science Laboratory<br>Indiana University<br></div></div>
</div></div></div></div>