<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>I am trying to run maker using MPI, and I get an error I do not understand.</div><div><br></div><div>Maker version: 2.13.6</div><div>mpiexec version: mpiexec (OpenRTE) 1.6.5</div><div>
<br></div><div>When I run ./Build status it is reported that MPI is enabled.</div><div><br></div><div>When I run mpiexec -n 40 maker I get the following errors:</div><div><br></div><div>







<p class="">[assembly:25562] mca: base: component_find: unable to open /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_paffinity_hwloc: perhaps a missing symbol, or compiled for a different version of Open MPI? (ignored)</p>
<p class="">[assembly:25563] mca: base: component_find: unable to open /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_paffinity_hwloc: perhaps a missing symbol, or compiled for a different version of Open MPI? (ignored)</p>
<p class="">[assembly:25562] mca: base: component_find: unable to open /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_carto_auto_detect: perhaps a missing symbol, or compiled for a different version of Open MPI? (ignored)</p>
<p class="">[assembly:25563] mca: base: component_find: unable to open /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_carto_auto_detect: perhaps a missing symbol, or compiled for a different version of Open MPI? (ignored)</p>
<p class="">[assembly:25563] mca: base: component_find: unable to open /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_carto_file: perhaps a missing symbol, or compiled for a different version of Open MPI? (ignored)</p>
<p class="">[assembly:25562] mca: base: component_find: unable to open /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_carto_file: perhaps a missing symbol, or compiled for a different version of Open MPI? (ignored)</p>
<p class="">[assembly:25563] mca: base: component_find: unable to open /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_shmem_mmap: perhaps a missing symbol, or compiled for a different version of Open MPI? (ignored)</p>
<p class="">[assembly:25563] mca: base: component_find: unable to open /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_shmem_posix: perhaps a missing symbol, or compiled for a different version of Open MPI? (ignored)</p>
<p class="">[assembly:25562] mca: base: component_find: unable to open /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_shmem_mmap: perhaps a missing symbol, or compiled for a different version of Open MPI? (ignored)</p>
<p class="">[assembly:25562] mca: base: component_find: unable to open /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_shmem_posix: perhaps a missing symbol, or compiled for a different version of Open MPI? (ignored)</p>
<p class="">[assembly:25563] mca: base: component_find: unable to open /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_shmem_sysv: perhaps a missing symbol, or compiled for a different version of Open MPI? (ignored)</p>
<p class="">[assembly:25562] mca: base: component_find: unable to open /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_shmem_sysv: perhaps a missing symbol, or compiled for a different version of Open MPI? (ignored)</p>
<p class="">--------------------------------------------------------------------------</p>
<p class="">It looks like opal_init failed for some reason; your parallel process is</p>
<p class="">likely to abort.  There are many reasons that a parallel process can</p>
<p class="">fail during opal_init; some of which are due to configuration or</p>
<p class="">environment problems.  This failure appears to be an internal failure;</p>
<p class="">here's some additional information (which may only be relevant to an</p>
<p class="">Open MPI developer):</p>
<p class=""><br></p>
<p class="">  opal_shmem_base_select failed</p>
<p class="">  --> Returned value -1 instead of OPAL_SUCCESS</p>
<p class="">--------------------------------------------------------------------------</p>
<p class="">--------------------------------------------------------------------------</p><p class=""><br></p><p class=""><br></p><p class="">Etcetera etcetera.</p><p class="">However: when I search for the files reported as missing I do find them, and I don't believe they are from a different version of MPI?<br>
<br>Am I using a wrong version of MPI?<br><br>Any help would be appreciated,</p><p class="">Sincerely,</p><p class=""><br></p><p class="">Rens Holmer</p></div><div><br></div>







</div>