<div dir="ltr">​<br><div class="gmail_chip gmail_drive_chip" style="width:396px;height:18px;max-height:18px;background-color:#f5f5f5;padding:5px;color:#222;font-family:arial;font-style:normal;font-weight:bold;font-size:13px;border:1px solid #ddd;line-height:1"><a href="https://drive.google.com/file/d/0BxTwS_7TqV3GUVVYSTFPM3M0TDQ/edit?usp=drive_web" target="_blank" style="display:inline-block;overflow:hidden;text-overflow:ellipsis;white-space:nowrap;text-decoration:none;padding:1px 0px;border:medium none;width:100%"><img style="vertical-align: bottom; border: none;" src="https://ssl.gstatic.com/docs/doclist/images/icon_10_generic_list.png"> <span dir="ltr" style="color:#15c;text-decoration:none;vertical-align:bottom">error.log.gz</span></a></div>​Hi ,<div><br></div><div>I am trying to run maker on a rice genome assembly. The assembly has about 1074 contigs and maker successfully runs on about 655 contigs and fails on the rest of them. I ran a few times on the failed contigs changing the number of tries , clean try option set to true and also increasing the memory.  None of these options worked. Please help me figure  out the problem with my maker run. I have attached the error file with this mail</div><div><br></div><div><br>Thanks </div><div><br>Srividya Ramakrishnan</div><div>Computational Science Analyst,</div><div>Cold Spring Harbor Laboratory,</div><div>1 Bungtown Rd,</div><div>Cold Spring Harbor , NY 11743​​</div></div>