<div dir="ltr">Good afternoon<div><br><div>I am having problems with my all.maker.proteins.fasta file.</div><div><br></div><div>I ran maker with ab initio gene predictions from augustus and genemark and I added my fgenesh gff file to the pred_gff option in the ctl file.</div><div><br></div><div>However, my maker protein fasta file does not give the fgenesh proteins IDs similar to that for augustus and genemark. </div></div><div><br></div><div>For example: </div><div>







<p class="gmail-p1"><span class="gmail-s1">>FGENESH protein AED:0.06 eAED:0.06 QI:0|0|0|1|1|1|3|0|433</span></p><p class="gmail-p1">vs.</p><p class="gmail-p1"><span class="gmail-s1">







</span></p><p class="gmail-p1"><span class="gmail-s1">>maker-scaffold74-augustus-gene-0.179-mRNA-1 protein AED:0.07 eAED:0.07 QI:123|1|1|1|1|1|5|793|326</span></p><p class="gmail-p1">I would appreciate any advice on this matter.</p><p class="gmail-p1">Kind regards</p><p class="gmail-p1">Alisa</p></div></div>