<div dir="ltr"><div>Hello:<br><br></div>I am trying to annotate the new genome of  a rodent species. I saw a clear pipeline to train the SNAP gene finder. But not clear what I should do if I also want to include augustus and/or GeneMark. Do I need to (could I and how) train it in Maker? In one of recently published paper, they mention the augustus was trained in Maker, but I am not clear how to do it? I wonder what's you opinions on using other gene finders in Maker. Thanks<br><br><span style="font-size:12pt;font-family:cambria">"Unique features of a global human ectoparasite identified
through sequencing of the bed bug genome." Nat Commun, 2016.<u> </u>In this paper, the training step was described as below.<u><br></u></span><div><div>

















<b><span style="font-size:12pt;font-family:helvetica">Three rounds of
training of the Augustus and SNAP gene predictors within Maker were used to
bootstrap to a high-quality training set.</span></b> <br><br><br></div><div>Best<br></div><div>Quanwei<span style="font-size:12pt;font-family:cambria"></span>



</div></div></div>