<P>Dear developer of Maker,</P>
<P>        I have used Maker to evaluate the genome annotation annotated by PASA. I have the transcript assembled by stringtie, genome (fasta), and the annotation file (gff3). How can I use the data to get the AED value from Maker? I have set the parameter of maker_opts.ctl. Can you help me to solve this? I only want to get the AED about the annotation file (gff3). Thank you very much!</P>
<P>        And there is also a question, I can not have a new post on <A href="https://groups.google.com/forum/#!forum/maker-devel" target="_blank">https://groups.google.com/forum/#!forum/maker-devel</A>. Why? Can you help me to solve this? Thank you!</P>
<P> </P>
<P>         Best,</P>
<P>         Wangzhennan</P>
<P>        <BR><BR></P><SPAN></SPAN><br><br><br>