<div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div>Hi,<br><br></div>Would there be any benefit to passing CDS instead of cDNA sequences as alternative EST evidence, if both is available? Or when would you use one or the other?<br><br></div>I've read in previous discussions how it's expected that the organism, from which we use sequences as alternative EST and protein evidence, is not closely related to the genome we are annotating.<br></div>In what terms is "closely related" defined? It's now unclear to me when you would put EST/protein evidence as alternative and when not or put it as direct EST/protein evidence?<br></div>Would a species from the same family classify as alternative or direct evidence? Is ~30mya divergence too much?<br>What about species of the same genus?<br><br></div>Many thanks!<br></div>Miche<br></div>