<div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Hi Carson,<br></div>We finally got Maker working with MPI (mpich, openmpi was a dead end...) and I have a question about how Maker distributes the computation load.<br></div>I know, correct me if I'm wrong, that with MPI, Maker runs blast in parallel (1 instance per thread) for protein2genome and est2genome. This indeed improves enormously the speed for the initial run.<br></div>But, does it take advance of this at the time of running the gene predictors? I think there is no benefit on multiple cpus in non-MPI mode but I have no idea in MPI.<br></div>Thank you in advance,<br></div>Xabi<br clear="all"><div><div><div><div><div><div><br>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>Xabier Vázquez-Campos, <i>PhD</i><br><i>Research Associate</i><br>NSW Systems Biology Initiative<br>School of Biotechnology and Biomolecular Sciences<br>
The University of New South Wales<br>Sydney NSW 2052 AUSTRALIA<br></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div></div></div></div></div></div></div>