<div dir="ltr"><div>Hello:<br><br></div>I ran the maker2 pipeline and got the default gene sets (with AED<1). But I found there are several hundred genes with eAED 1. <br><br>Below is an example, the gene has AED 0.05 and eAED 1. I wonder what can be the reason of the great difference between AED and eAED. For this gene it has a very low AED score, is it still a reliable gene model if its eAED equals 1?  <br><div><div><br>>maker-Contig2656-snap-gene-269.6-mRNA-1 protein AED:0.05 eAED:1.00 QI:75|0|0|1|0|0|2|111|35<br></div><div><br></div><div>Thanks</div><div><br></div><div>Best</div><div>Quanwei<br></div></div></div>