<div dir="ltr">Carson commented on this here<br><a href="https://groups.google.com/forum/#!msg/maker-devel/wtmNRtRa-ko/iC4KTuIitGEJ">https://groups.google.com/forum/#!msg/maker-devel/wtmNRtRa-ko/iC4KTuIitGEJ</a><br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 5 October 2017 at 09:31, Quanwei Zhang <span dir="ltr"><<a href="mailto:qwzhang0601@gmail.com" target="_blank">qwzhang0601@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Hello:<br><br></div>I ran the maker2 pipeline and got the default gene sets (with AED<1). But I found there are several hundred genes with eAED 1. <br><br>Below is an example, the gene has AED 0.05 and eAED 1. I wonder what can be the reason of the great difference between AED and eAED. For this gene it has a very low AED score, is it still a reliable gene model if its eAED equals 1?  <br><div><div><br>>maker-Contig2656-snap-gene-<wbr>269.6-mRNA-1 protein AED:0.05 eAED:1.00 QI:75|0|0|1|0|0|2|111|35<br></div><div><br></div><div>Thanks</div><div><br></div><div>Best</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div>Quanwei<br></div></font></span></div></div>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
maker-devel mailing list<br>
<a href="mailto:maker-devel@box290.bluehost.com">maker-devel@box290.bluehost.<wbr>com</a><br>
<a href="http://box290.bluehost.com/mailman/listinfo/maker-devel_yandell-lab.org" rel="noreferrer" target="_blank">http://box290.bluehost.com/<wbr>mailman/listinfo/maker-devel_<wbr>yandell-lab.org</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>Xabier Vázquez-Campos, <i>PhD</i><br><i>Research Associate</i><br>NSW Systems Biology Initiative<br>School of Biotechnology and Biomolecular Sciences<br>
The University of New South Wales<br>Sydney NSW 2052 AUSTRALIA<br></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div>