<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none"><!--P{margin-top:0;margin-bottom:0;} @font-face
        {font-family:"Cambria Math"}
@font-face
        {font-family:Calibri}
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif}
a:link, span.MsoHyperlink
        {color:blue;
        text-decoration:underline}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {color:purple;
        text-decoration:underline}
p.msonormal0, li.msonormal0, div.msonormal0
        {margin-right:0in;
        margin-left:0in;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif}
span.EmailStyle18
        {font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:windowtext}
.MsoChpDefault
        {font-size:10.0pt}
@page WordSection1
        {margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in}
div.WordSection1
        {}--></style>
</head>
<body dir="ltr" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<p>Hi Carson, </p>
<p><br>
</p>
<p>1) I think I have read one of your post saying that running maker with MPI is faster than multiple instance, can you explain why ?<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>2) I am trying to annotate a 1GB specie but it's superslow.</p>
<p>I have filtered the transcriptome to speed up the process but do you have other suggestion to increase the speed ?
<br>
</p>
<div id="Signature">
<div name="divtagdefaultwrapper" style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:; margin:0">
<br>
</div>
<div name="divtagdefaultwrapper" style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:; margin:0">
Cheers,</div>
<div name="divtagdefaultwrapper" style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:; margin:0">
<br>
Patrick Tran Van<br>
<br>
<br>
</div>
</div>
</body>
</html>