<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>I am trying to submit my genome i annotated using maker and they sent back this error,</div><div>1. <span style="font-size:12.800000190734863px">Please remove any N nucleotides from the beginning or end of the sequence</span></div><div><span style="font-size:12.800000190734863px"> 2.No feature should begin or end inside a gap.  Instead the feature should</span><br style="font-size:12.800000190734863px"><span style="font-size:12.800000190734863px">be made partial at the gap boundary.</span><br style="font-size:12.800000190734863px"><br style="font-size:12.800000190734863px"><span style="font-size:12.800000190734863px">[3] Coding regions should not be 5' partial if they begin with the start</span><br style="font-size:12.800000190734863px"><span style="font-size:12.800000190734863px">methionine.  If this is an internal methionine int he translation than</span><br style="font-size:12.800000190734863px"><span style="font-size:12.800000190734863px">it is fine if they are partial.  Conversely, all coding regions</span><br style="font-size:12.800000190734863px"><span style="font-size:12.800000190734863px">must have a stop codon or be 3' partial.</span></div><div><span style="font-size:12.800000190734863px">You have a large number of gene features that are not associated</span><br style="font-size:12.800000190734863px"><span style="font-size:12.800000190734863px">with other features.  Please include on these features in the</span><br style="font-size:12.800000190734863px"><span style="font-size:12.800000190734863px">gene description field some description of what the gene would</span><br style="font-size:12.800000190734863px"><span style="font-size:12.800000190734863px">have encoded.</span><br style="font-size:12.800000190734863px"><br style="font-size:12.800000190734863px"><span style="font-size:12.800000190734863px">A feature table example of this is:</span><br style="font-size:12.800000190734863px"><br style="font-size:12.800000190734863px"><span style="font-size:12.800000190734863px"><41156  >40652  gene</span><br style="font-size:12.800000190734863px"><span style="font-size:12.800000190734863px">                        gene_desc       transposon</span><br style="font-size:12.800000190734863px"><span style="font-size:12.800000190734863px">                        locus_tag       CR513_45338</span><br style="font-size:12.800000190734863px"><span style="font-size:12.800000190734863px">                        note    nonfunctional due to frameshift</span><span style="font-size:12.800000190734863px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.800000190734863px">Please how can i use maker to solve this problem?</span></div><div><span style="font-size:12.800000190734863px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.800000190734863px"><br></span></div><div><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Nnadi Nnaemeka Emmanuel<div>Department of Microbiology,</div><div>Faculty of Natural and Applied Science,</div><div>Plateau State University, Bokkos, Plateau State, Nigeria.</div><div>Publications:  <a href="https://www.researchgate.net/profile/Emmanuel_Nnadi/publications" target="_blank">https://www.researchgate.net/profile/Emmanuel_Nnadi/publications</a></div></div></div></div>
</div></div>