<div dir="ltr"><div><div><div><div>Hey guys,<br><br></div>Attached there is a picture of a recent MAKER run where I used pacbio reads and trinity assembled short reads plus proteins from Swissprot. I don't really get why MAKER assigns such a large fraction to be a UTR. From the name I can tell that the final gene model stems from a snap ab-initio prediction but even that gene prediction is not 100% identical to the part of the gene model which is not UTR.<br><br></div>Is there any setting in MAKER in which I can somehow have an influence on how MAKER assigns such UTRs? I already tried out the "correct_est_fusion" option but it did not help.<br><br></div>best<br><br></div>Timo<br></div>