<div dir="ltr">Dear MAKER2 admins:<div><br></div><div>Hi, I have read some tutorials for annotating a newly assembly genome and MAKER2 seems to be a very good and functional pipeline to me. So I am trying to use it to annotate a new assembly mammalian genome that our lab just generated.  </div><div>But I was stuck while I was trying to install MAKER2 to our slurm HPC server.</div><div><div style="color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:16px;margin-top:0px;margin-bottom:0px">I think the pipeline is trying to install several perl packages locally, but one of them called DBD::Pg requires the path of pg_config?</div><div style="color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:16px;margin-top:0px;margin-bottom:0px">screenshot as below</div><div style="color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:16px;margin-top:0px;margin-bottom:0px"><img src="https://mail.nyumc.org/owa/service.svc/s/GetFileAttachment?id=AAMkAGRmYzE3ZjExLThjMzItNGQxMS05OGM0LWU5NGExYjc5MWIyOQBGAAAAAACpVqbn7tYzQLifEebW8ukrBwBOgb%2BSxtBoSZE%2BEcmK9A6nAAAAAAEJAABOgb%2BSxtBoSZE%2BEcmK9A6nAABIPNfSAAABEgAQAJxsIfkGrDlCnJqHObyOOlI%3D&X-OWA-CANARY=eq6C4of-NkyZSuTGiLZzmFB44EDLqNYIpokNnT3FD-7d-ju9iHHAsU2ojV6u33160Jwb8mwQJS0." id="gmail-img64372" style="width: 750px; max-width: 750px; max-height: 253px;"><br></div></div><div style="color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:16px;margin-top:0px;margin-bottom:0px">But I think our server doesn't have this path and I don't have root to install some other stuff, like <font face="Consolas,Menlo,Monaco,Lucida Console,Liberation Mono,DejaVu Sans Mono,Bitstream Vera Sans Mono,Courier New,monospace,sans-serif" size="1" color="#242729"><span style="font-size:13px;background-color:rgb(239,240,241)">libpq-dev or </span></font><font face="Arial,Helvetica Neue,Helvetica,sans-serif" size="2" color="#242729" style="font-size:small"><span style="font-size:15px;background-color:rgb(239,240,241)">PostgreSQL. </span></font></div><div style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><font face="Arial,Helvetica Neue,Helvetica,sans-serif" size="2" color="#242729" style="color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:small"><span style="font-size:15px;background-color:rgb(239,240,241)">Is that any other methods that can </span></font><font color="#242729" face="Arial, Helvetica Neue, Helvetica, sans-serif"><span style="font-size:15px">circle around that?</span></font></div><div style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><font color="#242729" face="Arial, Helvetica Neue, Helvetica, sans-serif"><span style="font-size:15px"><br></span></font></div><div style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><font color="#242729" face="Arial, Helvetica Neue, Helvetica, sans-serif"><span style="font-size:15px">Any help or advice would be appreciated!</span></font></div><div style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><font color="#242729" face="Arial, Helvetica Neue, Helvetica, sans-serif"><span style="font-size:15px"><br></span></font></div><div style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><font color="#242729" face="Arial, Helvetica Neue, Helvetica, sans-serif"><span style="font-size:15px">Thanks,</span></font></div><div style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><font color="#242729" face="Arial, Helvetica Neue, Helvetica, sans-serif"><span style="font-size:15px">Shaowen</span></font></div></div>