<div dir="ltr">Hi Nazila,<div>The right one to contact is Carson and Maker developer group (cced).</div><div>best,</div><div>Qing </div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, May 22, 2019 at 6:39 AM Koochekian, Nazila <<a href="mailto:koochen@miamioh.edu">koochen@miamioh.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Dear Maker group</div><div>My name is Nazila, I am a Ph.D. student at Miami University. I'm working on <i>Phrynosoma platyrhinos </i>genome annotation and I'm trying to use MAKER. So as a requirement I'm trying to use tRNAscan. First I used the latest version (2.0) and I got the first -q file but I faced a warning like this:</div><div><br></div><div><div dir="ltr">WARNING: -q exists already.</div><div dir="ltr"><br></div><div dir="ltr"> (O)verwrite file, (A)ppend to file, or (Q)uit program? </div><br class="gmail-m_1375453502368370222gmail-m_8010251362011796429gmail-m_-6785568013660156098gmail-Apple-interchange-newline"></div><div>And I tried overwrite and append but it just froze and didn't work anymore.</div><div>So I tried to use an older version (1.3.1) but this one is hard to make it work too. <span style="background-color:transparent">I'm getting an error:</span></div><div><br></div><div><div><div>Can't locate object method "new" via package "tRNAscanSE::Constants" (perhaps you forgot to load "tRNAscanSE::Constants"?) at /home/koochen/tRNAscan-SE-1.3.1/tRNAscan-SE line 57.</div></div><br class="gmail-m_1375453502368370222gmail-m_8010251362011796429gmail-m_-6785568013660156098gmail-Apple-interchange-newline"></div><div>Would you please help me with it? Which version should I use? And how could I solve the problem for that version?</div><div>Looking forward for your reply;</div><div>Thanks,</div><div>Nazila</div></div>
</blockquote></div>