
<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=utf-8"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">Dear Maker Dev Team:<div class=""><br class=""></div><div class="">I am using Maker for gene annotations and I separate different tracks in the GFF to visualize in a genome browser. As in the attached picture, there is a very long Maker gene “maker-chr9-augustus-gene-102.77”. Both Augustus and SNAP predict four short genes at this region. There is one long EST hit and three short protein hit. Maker annotates it as a long gene, I am wondering if it is indicated by EST hit? If annotating three or four short genes is the “correct” way, is it any settings I should change instead of removing the EST evidence?</div><div class=""><br class=""></div><div class="">Thanks</div><div class="">Qihua</div><div class=""><br class=""></div><div class=""><img apple-inline="yes" id="43BF240C-6A0A-4A8D-815D-F367CA27E896" height="484" width="892" apple-width="yes" apple-height="yes" src="cid:0FF775DB-4C12-4571-B901-AA8161209D59@ucr.edu" class=""></div></body></html>