<div style="line-height:1.7;color:#000000;font-size:14px;font-family:Arial"><div>Hello,</div><div>        I apologize for not posting directly to the archived forum but it appears that the option to enter new posts is disabled.</div><div>        Thank you for your continued support of Maker and your responses to the forum posts. I have been running Maker (V3.01.02) to annotate a apple genome that consists of 17 chromosome-length scaffolds and some small contigs.</div><div>        In my various tests in running Maker, the vast majority of the smaller contigs were annotated failed. I'm not sure the long scaffolds finished rather than smaller contigs.</div><div>        ```</div><div><div>        open3: fork failed: Cannot allocate memory at /data/liuyu/Software/maker/bin/../lib/File/NFSLock.pm line 1037 thread 1.</div><div>        --> rank=3, hostname=localhost.localdomain</div><div>       ERROR: Failed while collecting blastn reports</div><div>       ERROR: Chunk failed at level:1, tier_type:3</div><div>       FAILED CONTIG:scaffold1A</div><div><br></div><div>       deleted:0 hits</div><div>       ERROR: Chunk failed at level:4, tier_type:0</div><div>       FAILED CONTIG:scaffold1A</div></div><div>       ````</div><div>       The work in run.log.child.0 is FINISHED. While in the theVoid.scaffold1A/run.log.child.1, the error code showed below:</div><div>       ```</div><div>       STARTED CF_hap1_part3_rnd1.maker.output/CF_hap1_part3_rnd1_datastore/67/D7/scaffold1A//theVoid.scaffold1A/0/scaffold1A.1.66268.0.db%2E1-66268%2Efor_blastn%2Efasta.blastn</div><div>       DIED    RANK    3:4:0:2</div><div>       DIED    COUNT   1</div><div>       ````</div><div>      My command is "mpiexec -n 8 /data/liuyu/Software/maker/bin/maker -base CF_hap1_part3_test part3_round1_maker_opts.ctl maker_bopts.ctl maker_exe.ctl". The mpiexec is used by MPICH(v3.3.2). And When I test and use the MPICH2, the error is same. Meanwhile, when I use less number of processes, the task is failed too.</div><div>      Thanks for any troubleshooting tips you can offer.</div><div>Best wishes,</div><div>Yu Liu</div><div><br></div></div><br><br><span title="neteasefooter"><p> </p></span>