<div dir="ltr">Dear professor<br><br><br>maker is a great annotation software, when i using it, i have some strange problems. i added in the google group and browsed many questions, but i didnt get useful message for my question. <div><br></div><div>**By the way, i can not submit new question in google group(although i have added the group and subscribed), so i send this email to you.** <br><br><br>I check the log file, i found somehow a file was removed, but then it cannot find this file. Then the strange error happened.<br><br><br>-----<br><br><br>Removing file: /xtdisk/xueyb_group/wangchenA/Petunia_denovo/HiFi/09.anno/04.maker/part-hp1/hp1_HiC1/hp1_HiC1_rnd1.make<br><br>r.output/hp1_HiC1_rnd1_datastore/1D/F6/HiC_1//theVoid.HiC_1/HiC_1.35.end.blastx.holdover<br><br>----<br><br><br><br>ERROR: No such file or directory at /xtdisk/xueyb_group/wangchenA/Petunia_denovo/HiFi/09.anno/04.maker/part-hp1/hp1_Hi<br>C1/hp1_HiC1_rnd1.maker.output/hp1_HiC1_rnd1_datastore/1D/F6/HiC_1//theVoid.HiC_1/HiC_1.35.end.blastx.holdover<br><br><br>ERROR: Failed while collecting blastx reports<br>ERROR: Chunk failed at level:9, tier_type:3<br>FAILED CONTIG:HiC_1<br><br><br>merging blast reports...<br>doing blastn of ESTs<br>ERROR: Chunk failed at level:4, tier_type:0<br>FAILED CONTIG:HiC_1<br><br>----<br><br>any advice would be highly appreciated, i have been stopped in this strange errors for days.<br><br>I submit my job at PBS. (one node, 20cpu, mpiexec -n 20).  max_dna_len=100000. TMP=/tmp/<br><br>i dont know why the .blastx.holdover file was removed by maker/bin/../lib/Process/MpiChunk.pm?  the blast start or end coordinate is removed because of uncomplete blast? so the blast report is truncated? <div><br></div><div>---</div><div>ncbi-blast-2.12.0+</div><div>RepeatMasker was installed with rmblast-2.2.28<br><br><br>thank u<br><br><br>best regards<br><br><br>wangchen<br><br><br>student in chinese academy of sciences<br></div></div></div>