<html><head><meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8"></head><body dir="auto">Can you send me the STDERR from the maker run? If you don’t have it, run maker again with the output from the screen redirected to a file. Example —> maker &> all_output.txt<div><br><div dir="ltr">--Carson<div><br></div><div>Sent from my iPhone</div></div><div dir="ltr"><br><blockquote type="cite">On Jul 31, 2023, at 10:04 AM, Hayley Mangelson <hayley@phasegenomics.com> wrote:<br><br></blockquote></div><blockquote type="cite"><div dir="ltr"><div dir="ltr">Hi!<br><br>I am trying to get a fresh install of MAKER to work for me and am having a few issues. <br><br>1. I got MAKER installed (I thought) and now the log is saying all contigs failed. See attached log.<br>2. Having tried several versions and methods of installation, I cannot get multithreading to work.<br><br>Could you help me work through these issues?<br clear="all"><div>Thanks,<br><br>Hayley</div><span class="gmail_signature_prefix">-- </span><br><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><font color="#666666">Hayley Mangelson<br></font></div><div><font color="#666666">Senior Bioinformatics Lead</font></div><div><font color="#666666">Phase Genomics, Inc</font></div><div><a href="http://www.phasegenomics.com/" style="color:rgb(17,85,204)" target="_blank">www.phasegenomics.com</a><font color="#666666"><br></font></div><div><br></div></div></div></div></div></div></div>
<div><PGA_assembly_hap1_master_datastore_index.log></div><span>_______________________________________________</span><br><span>maker-devel mailing list</span><br><span>maker-devel@yandell-lab.org</span><br><span>http://yandell-lab.org/mailman/listinfo/maker-devel_yandell-lab.org</span><br></div></blockquote></div></body></html>